JavaScriptобъектно-ориентированный язык, и все элементы в нём - о б ъ е к т ы,
с которыми он и работает. Модальные окна - это методы объекта Window.
То, что показал здесь - самый простой метод alert();
Часто использую его лишь только для проверки соединения с внешними файлами, а для контакта с посетителями обычно используются
другие методы этой же группы: prompt(); confirm(); open();
Их действие посмотрите на других страницах этого раздела "Портфолио".
*P.S. Модальное окно будет появляться при каждой перезагрузке страницы.
А вот предупреждение о запрещённом JavaScript только 1 раз, если Вы его разрешите.
Раз странице разрешили использовать JavaScript, так она и будет его использовать до своего закрытия, не выводя никаких надписей.